הלימודים לתואר מוסמך האוניברסיטה במדעים(M.Sc)

יושב ראש הוועדה החוגית לתואר שני: פרופסור דניאל שר

חבר הוועדה החוגית לתואר שני: דוקטור יגאל ברנשטיין

מבוא 

האוקיאנוסים והימים מכסים כ-70% מפני כדור הארץ ושוקקים חיים: אצות מיקרוסקופיות מהוות בסיס למערכות אקולוגיות מורכבות – מפלנקטון ואלמוגים ועד לוויתנים. בשנים האחרונות עולה הצורך בהכשרת דור חדש של מדענים שיוכלו להנחות קבלת החלטות מדיניות ובין-לאומיות לשימוש במשאבי הים מחד גיסא ולשימורם מאידך. תלמידי החוג לביולוגיה ימית ישלבו מחקר מעמיק בביולוגיה ימית ברובד המולקולארי, הביוכימי, הפיזיולוגי והאקולוגי עם התמחות רב תחומית החובקת את מדעי הים, מתוך מטרה להיות מנהיגי העתיד בתחום הימי.

תנאי קבלה

1. לחוג יוכלו להתקבל בוגרי תואר ראשון במדעים (B.Sc) בביולוגיה, במדעי הים, או במדעים הקשורים לתחומים אלה ממוסד מוכר להשכלה גבוהה בארץ או בחוץ לארץ (ייתכן ויידרשו לימודי השלמה). דרישות הקדם לחוג הינן ברמת ידע של בוגר תואר ראשון בביולוגיה. הידע הנדרש הוא בתחומים הבאים: ביוכימיה, פיזיולוגיה, אקולוגיה, ביולוגיה מולקולרית, אנגלית, מחשב.
2. ציון סופי משוקלל 85 לפחות בכל אחד מהחוגים הנלמדים לתואר ראשון.
3. לצורך קבלה לחוג על המועמד להגיש קורות חיים באנגלית, מכתב הצהרת כוונות באנגלית וגיליון ציונים רשמי.

4. טרם תחילת לימודיו או במהלך הסמסטר הראשון ללימודיו יידרש התלמיד להתקשר עם מנחה פוטנציאלי (חבר סגל בחוג) ולסכם על נושא המחקר. הודעת המנחה על נכונותו להנחות את הסטודנט בעבודת התיזה שלו עד תום הסמסטר הראשון ללימודים, תהווה תנאי להמשך הלימודים בחוג בסמסטר השני.

5. מועמדים בוגרי תואר ראשון במקצועות אחרים, שקיבלו ציון נמוך מ-85 אך גבוה מ-80 בלימודי התואר הראשון, או שחסרים להם חלקים מהידע הנדרש, יוכלו להתקבל ללימודים בחוג במעמד “על תנאי״ על פי החלטת הוועדה החוגית ללימודי התואר השני, בתנאי שישלימו את הידע החסר עד סוף שנת הלימודים הראשונה. הוועדה החוגית ללימודי תואר שני תקבע את תוכנית ההשלמה לכל סטודנט בהתאם לרקע האקדמי שלו ולדרישות המחקר. סיום לימודי ההשלמה בציון ממוצע 85 ומעלה יהווה תנאי להמשך הלימודים בחוג.

6. מועמדים בוגרי אוניברסיטאות מוכרות מחוץ לארץ וכן בוגרי אוניברסיטאות בעלות שלוחות בישראל, אשר פועלות באישור המועצה להשכלה גבוהה, יחויבו לעמוד בהצלחה בבחינת ה־GRE. פרטים נוספים על מבחן GRE ניתן למצוא בתקנון לימודי תואר שני ובקישור: http://www.ets.org/gre/
7. במקרים בהם שפת האם אינה אנגלית והלימודים במוסד הלימודים הקודם לא נערכו באנגלית: נדרש אישור פטור רשמי מאנגלית שנתקבל במהלך לימודי התואר הראשון, או פטור רשמי המבוסס על תוצאת המבחן הפסיכומטרי. במידה ולא מוצג אחד מהאישורים הללו נדרש ציון TOFEL מינימלי של 550 (מבחן כתוב), 213 (מבחן ממוחשב) או 80 (מבחן מקוון).

משך הלימודים

הלימודים בחוג נפרסים על פני שתי שנות לימוד (לא כולל לימודי השלמות). מרבית קורסי החובה יתקיימו במשך שנת הלימודים הראשונה וירוכזו במידת האפשר בשני ימי לימוד בשבוע. במהלך השנה הראשונה הסטודנטים ישתתפו בסיור לימודי בים. הפלגה זו תשמש סדנא למספר קורסים והנתונים שיאספו בה יעובדו במסגרתם. כתנאי ליציאה לסיורים הלימודיים ולהפלגה הלימודית, המהווים חלק מחובות קורסי החובה, נדרשים התלמידים למלא הצהרה רפואית המודיעה על כך שהם כשירים מבחינה רפואית לצאת לסיורים.

מבנה הלימודים

הלימודים הם במסלול א׳ בלבד, הכולל מחקר וכתיבת עבודת גמר מחקרית (תזה).

תכנית הלימודים כוללת:

היקף הלימודים בתוכנית הינו 36 שעות שבועיות סמסטריאליות על פי הפירוט הבא:

קורסי ליבה (חובה) בהיקף של 20 שעות שבועיות סמסטריאליות.

קורסי עומק (בחירת חובה) בהיקף של 8 שעות שבועיות סמסטריאליות, מתוך רשימה המכילה קורסים המועברים בחוג לביולוגיה ימית, חוגים נוספים באוניברסיטת חיפה וקורסים הניתנים במכון הבין-אוניברסיטאי באילת.

קורסי בחירה כללים (בחירה חופשית) בהיקף 4 שעות שבועיות סמסטריאליות, בתיאום עם המנחה ויושב ראש ועדה חוגית.

כתיבת עבודה מחקרית (תזה) בהיקף של 4 שש"ס.

השתתפות חובה בסמינריון החוגי ובסמינר הבית ספרי בהם מתארחים מרצים מאוניברסיטאות אחרות בארץ ובחו"ל, למשך הלימודים (שנתיים אקדמאיות). חובת ההשתתפות היא ב 80% מהסמינרים. כמו כן על הסטודנט להשתתף בסמינרי הגנה על התיזה של סטודנטים מהמחלקה לביולוגיה ימית.

רשימת הקורסים:

        Course name                                                                                                   Credit   

Challenges in the Mediterranean Sea                                                    2

Mediterranean seminar and field trips                                                 2

Physical Oceanography for Marine Sciences                                       2  

Biogeochemical Oceanography                                                             2

Research Student Forum                                                                        2

Experimental design                                                                                4

Methods in Marine Biology A                                                             2

Methods in Marine Biology B                                                              4

 20       

קורסי בחירה

Course name                                                                                            Credit

Method in Bioinformatics                                                                  3    

Biological regulation of development processes                           2 

Scientific writing                                                                                   2

   Marine Microbiology                                                                           2       

From Academy to industry                                                                2  

Diving course                                                                                        3

   Research seminar in quantitative biology and modeling             2              

Rocky Shore Ecology course                                                             2

Research seminar on Symbiosis in aquatic systems                    2

20

 ניתן להירשם לקורסים לתארים מתקדמים ב-IUI   –  http://iui-eilat.ac.il/Courses/Courses2.aspx

הערה: קורסי החוג (כולל קורסי חובה) יינתנו בשפה האנגלית.

הציון הסופי יורכב כדלקמן:

30% – ציוני הקורסים, כולל עבודה סמינריונית אחת

40% – עבודת הגמר המחקרית (תזה)

30% – בחינת הגנה על התיזה (הבחינה תיערך בעל-פה)

לימודים לתואר מוסמך האוניברסיטה במדעים  –M.Sc עם התמחות בביואינפורמטיקה*

מרכז המסלול לביואינפורמטיקה בפקולטה למדעי הטבע: דוקטור איל פריבמן

מרכז המסלול לביואינפורמטיקה בחוג לביולוגיה ימית: פרופסור דניאל שר

ביואינפורמטיקה הינו מקצוע צעיר, מתפתח וחשוב, שמקומו בענפי המחקר והתעשייה העתידיים הולך וגדל. כמויות המידע הביולוגי שמתווספות וההתפתחות המרשימה בענפי הביוטכנולוגיה הציבו אתגרים חדשים בפני המדע והתעשייה, והובילו להתפתחות מקצוע בינתחומי זה. הביואינפורמטיקה מתמודדת באמצעות אלגוריתמים מתמטיים ושיטות חישוביות עם שאלות ביולוגיות.

מטרת תכנית ההתמחות בביואינפורמטיקה היא להקנות לתלמידים לתואר מוסמך בביולוגיה של האדם את עקרונות המחקר החישובי של נתונים ביולוגיים רחבי היקף, ובמיוחד רצפים גנומיים, ביטוי גנים, מבני חלבונים, ורשתות מולקולריות בתא.

*תחום ההתמחות יצוין על גבי תעודת המוסמך.

תנאי קבלה – כפי שמפורט בתנאי קבלה ללימודי תואר שני. 

תכנית הלימודים כוללת: התכנית היא בהיקף של 36 שש"ס. מתוכם:

• • קורס אחד (תכנון ניסויים) חובה עבור שתי התכניות (4 שש"ס)
  • 16 שש"ס קורסי חובה בחוג לביולוגיה ימית
  • 7 שש"ס קורסי חובה במסלול לביואינפורמטיקה
  • שאר הקורסים מרשימת קורסי חובת הבחירה של שתי התכניות. סך השש"ס מהתכנית לביואינפורמטיקה לא יהיה פחות מ- 14 שש"ס.
  • כתיבת עבודה מחקרית (תזה) בהיקף של 4 שש"ס.
    קורסי חובה לכל תלמידי התכנית לביואינפורמטיקה
    

    שם הקורס	סה"כ שש"ס	שעות שיעור/סמינריון	שעות תרגיל
    שיטות מחקר בביואינפורמטיקה	4
    תכנות ב- Python לביולוגים*	3
    תכנון ניסויים**	4

    *קורס חובה עבור סטודנט שלא למד קורס תכנות במסגרת לימודים קודמים (על הסטודנט לקבל אישור בכתב על פטור מקורס זה)

    **קורס זה חופף את תכנית לימודי החובה של החוג לביולוגיה ימית. ניתן לקחת קורסים חלופיים בשיטות סטטיסטיות מתקדמות באישור ועדת ההוראה

    קורסי בחירת חובה (התכנית לביואינפורמטיקה)

    שם הקורס	סה"כ שש"ס	שעות שיעור/סמינריון	שעות תרגיל
    אלגוריתמים בגנומיקה חישובית	3
    שיטות הסתברותיות בגנומיקה	3
    מיפוי גנומי	2
    סדנה בביואינפורמטיקה (מרוכזת במהלך הסמסטר)***	3
    יסודות האבולוציה המולקולרית	2
    R	3
    אבולוציה מיקרוביאלית	2
    מיקרוביולוגיה ימית	2
    בקרת גנים****	2
    אבולוציה כאלגוריתם למידה
    ביואינפורמטיקה מבנית	3
    למידה עמוקה
    ביולוגיה כמותית ומודלים

    *** ניתן לקחת את הסדנה מספר לעמים במהלך התואר, בתנאי שנושאי הסדנה שונים ובאישור ועדת ההוראה

    **** הקורס ניתן פעם בשנתיים

  • חלק מהקורסים יינתנו באנגלית

תקנון חוגי מלא ניתן למצוא באתר החוג:

http://marsci.haifa.ac.il/index.php/he/marbio-he

הלימודים לתואר דוקטור לפילוסופיה (Ph.D) 

יושב ראש הוועדה החוגית לתואר שלישי: פרופסור טלי מס

מטרת הלימודים לתואר דוקטור בתחום הביולוגיה ימית הוא לעודד ולקדם את המחקר בתחום מדעי הים ואוקינואוגרפיה ימית. תוצאות המחקרים השונים שיתבצעו במסגרת החוג יפורסמו בבמות החשובות ביותר של כתבי עת מקצועיים בינלאומיים. המסלול יאפשר לסטודנטים מצוינים לבצע את מחקרם בחוג המאגד מגוון של דיסציפלינות בתחום הביולוגיה הימית. 

תנאי קבלה ללימודי דוקטורט בחוג:

למסלול יתקבלו תלמידים מצטיינים בעלי תואר שני (M.Sc או תואר מקביל) במסלול עם כתיבת תזה בביולוגיה ימית, אוקיאנוגרפיה ביולוגית, או במדעים הקשורים לתחומים אלה, ממוסד מוכר להשכלה גבוהה בארץ או בחו"ל. תלמידים מצטיינים בעלי תואר שני מתחומים אחרים אשר יעמדו בתנאי הקבלה, יחויבו בלימודי השלמה לפי החלטת הוועדה החוגית ללימודי תואר שלישי. יתקבלו תלמידים בעלי ציון ממוצע כללי של 90 לפחות לתואר מוסמך, כאשר הציון על עבודת התזה הוא 90 לפחות. תתכן החרגה במקרים מיוחדים ע"פ החלטת הוועדה החוגית ובאישור ראש החוג ובלבד שיעמדו בתנאי הקבלה המינימליים כמפורט בתקנון לימודי תואר שלישי. תלמידים שמאמר ממחקר המוסמך שלהם התפרסם (ושהם רשומים עליו כמחבר ראשון) או כתב-יד שנשלח לפרסום בכתב-עת מדעי בינלאומי, יזכו לעדיפות.

מהלך הלימודים במסלול לדוקטורט:

משך תכנית המחקר והלימודים הוא ארבע שנים. לקבלת התואר "דוקטור לפילוסופיה" ידרשו התלמידים למלא את התנאים הבאים:

1. מציאת מנחה למחקר: קבלה למסלול דוקטורט תלויה בהודעה כתובה של המנחה על נכונותו להנחות את הסטודנט ולדאוג לצרכי המחקר שלו. יש להקשר עם מנחה פוטנציאלי אחד לפחות, שהינו חבר סגל בדרגת מרצה בכיר ומעלה באוניברסיטת חיפה. יש לספק מסמך זה כחלק מרשימת המסמכים הנדרשת בעת הגשת המועמדות. ערכת ההרשמה תועבר למועמד על ידי מזכירות החוג.
2. קביעת נושא המחקר: על הסטודנט להגיש לוועדת הדוקטורט החוגית תקציר של תכנית המחקר (הצהרת כוונות) שיכלול הצגה של שאלת המחקר העיקרית ושל שיטות המחקר העומדות לרשותו לפתרונה כולל רשימת ספרות (ראה ערכת הרשמה).
3. קורסים וסמינריונים: במהלך לימודי הדוקטורט יחויב כל תלמיד בלימודי החובה בהיקף של  12 שש"ס, מתוכם 2 שש"ס במסגרת סמינר דוקטורנטים. יתרת הקורסים ייבחרו מרשימת הקורסים המוצעת ע"י החוג בתאום עם המנחה הישיר ובהתאם לתחום המחקר. במקרים מסוימים הסטודנט יוכל ללמוד קורס באוניברסיטה אחרת או קורס מקצועי באישור הוועדה החוגית ללימודי תואר שלישי והדיקן ללימודים מתקדמים. תלמיד אשר לא למד קורס כתיבה מדעית או לא פרסם מחקר בכתב עת בינלאומי במהלך אחד מהתארים הקודמים יחויב לקחת את הקורס. במידת הצורך יחויבו התלמידים בלימודי השלמה (מעבר למספר השש"ס הנדרשים להשלמת התואר) שיקבעו על ידי הוועדה החוגית ללימודי תואר שלישי של החוג על פי המלצות המנחה הישיר, זאת על פי תחום המחקר ולימודיהם הקודמים. 

4. השתתפות חובה בסמינריון החוגי ובסמינר הבית ספרי בהם מתארחים מרצים מאוניברסיטאות אחרות בארץ ובחו"ל, למשך הלימודים (ארבע שנים אקדמאיות). חובת ההשתתפות היא ב 80% מהסמינרים. כמו כן על הסטודנט להשתתף בסמינרי הגנה על התיזה של סטודנטים מהמחלקה לביולוגיה ימית.

5. במהלך השנה הראשונה ללימודים וכתנאי מעבר לשנה ב', יידרש/תידרש  הסטודנט/ית  ליטול חלק במינימום שני מפגשים ממסגרת ההכשרה של בית ספר בלום.

6. סטודנט/ית  אשר ייטלו חלק ב- 14 מפגשים, יוכלו לזכות בהכרה של 2 שעות שבועיות סמסטריאליות, וזאת, בכפוף לאישור הוועדה ללימודי תואר שלישי ובלבד שעמד במשך הזמן הנורמטיבי ללימודים הקבוע בתקנון.

7. מסגרת ההכשרה של בית ספר בלום תפורסם באתר האינטרנט של הרשות ללימודים מתקדמים, בית ספר בלום:  https://graduate.haifa.ac.il/index.php/he/component/sppagebuilder/?view=page&id=17

וועדה מלווה:

על פי שיקולי המנחה ובהמלצת ועדת ההוראה לדוקטורט תמונה וועדה מלווה לכל דוקטורנט עם הגשת הצעת המחקר. הוועדה המלווה תורכב משלושה חברים לפחות:

1. מנחה אחד או יותר אשר נתנו הסכמתם להנחות את התלמיד. המנחה/ים יהיה איש סגל באוניברסיטת חיפה בעל מינוי רגיל  מדרגת מרצה בכיר ומעלה, בהיקף של חצי משרה לפחות בחוג.
2. חבר סגל אקדמי הרשאי להנחות תלמידי מחקר, מבין חברי הסגל המכהנים באוניברסיטת חיפה, אשר נחשב כמומחה בתחום המחקר של עבודת הדוקטור או בתחומים קרובים.
3. חבר סגל אקדמי, הרשאי להנחות תלמידי מחקר, מחוץ לאוניברסיטת חיפה, אשר נחשב כמומחה בתחום המחקר של עבודת הדוקטור או בתחומים קרובים.

במידה ויעלה הצורך למנות מי שאינו עומד בקריטריונים – ניתן יהיה לפנות אל הוועדה החוגית ואל הדיקן ללימודים מתקדמים לקבלת אישורם. 

המנחה ישמש כיו"ר הוועדה המלווה. כאשר תלמיד המחקר מונחה על ידי יותר ממנחה אחד, המנחים יחליטו ביניהם מי מהם ישמש כיו"ר הוועדה המלווה. הועדה תיפגש עם הסטודנט לפחות פעם בשנה במהלך הדוקטורט: במשך המחקר וכחצי שנה לפני הגשת עבודת הדוקטורט, בפגישה זו הועדה תחליט אם הסטודנט יכול להגיש את עבודת הדוקטורט ותסכם את המלצתה בכתב. 

תכנית המחקר:

שלב א': שנת המחקר הראשונה בו נמצא התלמיד במעמד של תלמידי מחקר שלב א'. בסיומה של שנה זו יגיש הסטודנט את התוכנית המפורטת למחקר. חשוב להדגיש: בין אם התלמיד התקבל בתחילת הסמסטר או במהלכו, עליו להגיש את הצעת המחקר בדיוק שנה אחת מתחילת הסמסטר ולא מתחילת לימודיו. עם הגשת הצעת המחקר ולא יאוחר מסוף שנת הלימודים הראשונה, תמנה הוועדה החוגית ללימודי תואר שלישי את הוועדה המלווה לכל דוקטורנט על בסיס המלצת המנחה. הצעת המחקר תיבדק על-ידי הוועדה המלווה  והמנחה שלו ותאושר על ידם. על הסטודנט להיבחן על הצעת המחקר שלו בפורום המנחים והועדה המלווה. לאחר אישור הועדה המלווה יעבור הסטודנט למעמד של תלמידי מחקר שלב ב'. 

ביצוע המחקר ודו"ח התקדמות:

כל תלמיד לתואר שלישי חייב להגיש לוועדה החוגית ללימודי תואר שלישי דו"ח התקדמות שנתי מאושר על ידי המנחה/ים בראשית כל שנת לימודים. עותק מן הדו"ח  יישלח אל הרשות ללימודים מתקדמים ולוועדה המלווה.

שיפוט עבודת המחקר:

עם סיומו, יסוכם המחקר באחת משתי הדרכים הבאות:

1. דוקטורט פרסומים: צריך לכלול 3 פרסומים לפחות, דרישת הסף היא הגשת הפרסומים לכתבי העת בהתאם לתקנון של בית ספר בלום.
2. חיבור רגיל: במקרה כזה לא יכלול החיבור יותר ממאה ועשרים עמודים (לא כולל נספחים). 

 כחלק מהדרישות לקבלת דוקטורט, ובמהלך תהליך השיפוט, על הסטודנט להציג את עבודתו בהרצאה בפורום הסמינר החוגי.

לאחר אישור הגשת העבודה לשיפוט ע"י הגורמים המוסמכים לכך, תועבר עבודת הדוקטור לרשות ללימודים מתקדמים להמשך הליך השיפוט בהתאם לתקנון תואר שלישי.

לימודים במסלול ישיר לדוקטורט:

מסלול לימודים זה מיועד לתלמידים מצטיינים, שיש ברצונם להמשיך ברצף לקראת לימודי דוקטורט ושהחוג רואה בהם מועמדים ללימודי תואר שלישי.

תנאי קבלה עיקריים:

1. ציון ממוצע 90 לפחות בלימודי התואר הראשון ממוסד מוכר להשכלה גבוהה בארץ או בחו"ל.
2. הצהרת כוונות של המועמד לגבי המחקר המוצע מאושרת על ידי המנחה.

   המעבר למסלול ישיר לסטודנטים הנמצאים כבר בתוכנית לתואר שני יתבצע בסוף השנה הראשונה של לימודי המוסמך בשני תנאים:

1. שהתלמיד השלים קורסים בהיקף של 16 שש"ס לפחות וסיים בציון משוקלל של לפחות 90.
2. שהראה יכולות במחקר ניסויי העומדות בקריטריונים של סטודנט מחקר מצטיין.

מבנה הלימודים:

עם אישור הצעת המחקר ועמידה בכל החובות המפורטות לסטודנט במסלול הרגיל כולל השלמת סה"כ 36 שש"ס ולמידת כל קורסי החובה של החוג, יעבור התלמיד למעמד של דוקטורנט שלב ב' ויחולו עליו חובות הלימוד כמפורט לעיל (שאר הפרטים בהקשר למסלול זה ניתן לראות בתקנון לימודים מתקדמים).

תלמיד המעוניין להפסיק את לימודיו בשלב המוסמך של מסלול הישיר לדוקטורט, ולהשלים את לימודי המוסמך במסלול א' או ב', יהא רשאי לעשות זאת ובלבד שזכאותו לתואר שני במסלול הישיר טרם אושרה. במקרה זה על התלמיד יהיה להשלים את מכסת הלימודים ושאר החובות הנדרשים לקבלת התואר השני במסלול א' או במסלול ב', לפי העניין.